O TransÔnibus teve origem em 1959, a partir da fundação da Associação Profissional das Empresas de Transportes Rodoviários do Município de Nova Iguaçu, sediada na rua Otávio Tarquino, 101.

Em 1965, esta Associação, então presidida por Edson Dalmácio de Souza, da extinta Empresa de Transportes Municipal, já contava com 25 empresas associadas. Edson Dalmácio deu a partida para a transformação da Associação em Sindicato. No dia 17 de outubro de 1968, com a outorga da Carta Sindical, a Associação deu lugar ao Setranspani (atual TransÔnibus).

Em 1981, assumiu a presidência o empresário Narciso Gonçalves dos Santos. Com o apoio dos associados, o Sindicato passou a funcionar em sede própria, que ficava localizada na Avenida Marechal Floriano Peixoto, no centro de Nova Iguaçu. Em setembro de 1989, o Sindicato transferiu-se para nova sede, na Avenida Carlos Marques Rollo, 854, no bairro de Vila Nova, em Nova Iguaçu, Rio de Janeiro.

Mais moderna e melhor equipada, a nova sede foi expandida com a inauguração, em setembro de 1997, do prédio anexo, para abrigar o Programa de Ensino, que desde 1992 funcionava na antiga sede do Sindicato, em Nova Iguaçu, promovendo cursos de treinamento e qualificação para o trabalhador rodoviário, bem como alfabetização e ensinos fundamental e médio, entre outros serviços.

O TransÔnibus se modernizou e alcançou projeção nacional, tornando-se uma das entidades sindicais mais atuantes do setor de transportes, especialmente na área de educação e treinamento profissional para os rodoviários e empresas e de Responsabilidade Social, com o Projeto Criança Viva, o Programa EconomizAR e o Programa Despoluir.

Em 2008, quando completou 40 anos de fundação, o Setranspani passou a ter um novo nome, nova logomarca e novo slogan: TransÔnibus: integrando as cidades. A mudança marca uma nova etapa na história do Sindicato, em que mais do que representar empresas de ônibus de Nova Iguaçu e municípios vizinhos, o TransÔnibus se propõe a integrar essas cidades e contribuir mais diretamente para o progresso dessa região.